Carnajev je optužen da je, zajedno s ubijenim bratom Tamerlanom, 15. travnja detonirao dvije improvizirane eksplozivne naprave pored cilja maratona. Na mjestu je poginulo troje, a ozlijeđeno je više od 260 ljudi.
Nekoliko dana kasnije on i brat su se sukobili s bostonskom policijom, pri čemu je ubijen jedan policajac na području sveučilišta MIT. Nakon toga je uslijedila nezapamćena potjera i gotovo potpuna blokada Bostona. Tamerlan je poginuo, a Džohar je teško ozlijeđen ulovljen nakon oko 24 sata.
Prilikom današnjeg pojavljivanja u sudnici, Džohar se ponašao opušteno, članovima svoje obitelji poslao je poljubac, dok okupljene žrtve navodno nije ni pogledao.